肺結核的診斷，一般需要根據流行病學的資料、臨床的表現、實驗室的檢查和影像學檢查來綜合分析考慮。對於大部分的結核，主要是根據胸部的X線、肺部的CT以及痰檢的結果來決定。對於菌陽的肺結核是相對診斷比較容易的，如果有典型的CT表現加上痰找抗酸桿菌是陽性的，這種情況就可以明確診斷了。
還有一種情況是菌陰的肺結核，這種情況診斷相對比較困難。病人如果有典型的結核中毒症狀，比如咳嗽、咳痰、低熱、夜間盜汗等臨床表現，還有典型的影像學表現，也就是X線或者是CT提示肺結核，並且除外其他的原因，這種情況也可以診斷為肺結核。
