腦部CT分為平掃和增強，現在常用的腦部CT平掃，是一種腦部病變常用的影像檢查手段，它可以檢查出腦部的許多病變，按照從外到內的解剖順序來說：首先是頭皮的病變，比如頭外傷後的頭皮血腫，以及頭皮長出的皮質腺瘤，血管瘤等;其次則是顱骨的病變，顱骨的骨質破壞，顱骨本身的一些腫瘤，比如說骨瘤等，還有外傷後引起的顱骨骨折;最後則是顱內的腦組織，腦組織的病非常多。
CT平掃能夠發現的病變也非常多，像腦組織的腫瘤，還有腦組織的血管性病變，出血性和缺血性腦卒中，包括血管畸形，以及平時說的腦出血腦梗塞這一類非常常見的血管性病變。還有腦組織的炎症，腦組織的畸形，即大腦畸形、小腦畸形以及顱頸交界處的畸形。
而對於嬰幼兒和新生兒來說，還可以查到嬰幼兒的發育問題，新生兒缺氧缺血性腦病，還有腦積水這些疾病，這些都可以通過腦部CT檢查來發現。當然許多疾病可能需要進一步做磁共振來明確。
